نیتروژن جو توسط گیاه به آمونیوم [ناخوانا] [شکل: نمودار چرخه نیتروژن در خاک و ریشه شامل برچسب های: N2 خاک اندام های هوایی ریشه باکتری های تثبیت کننده نیتروژن باکتری های آمونیاک ساز باکتری های نیترات ساز مواد آلی $NH_{4}^{+}$ (آمونیوم) $NO_{3}^{-}$ (نیترات) $NH_{4}^{+}$ (روی ریشه) فلش های جریان نیتروژن از $N_{2}$ به سمت باکتری های تثبیت کننده و سپس $NH_{4}^{+}$، و جریان مواد آلی به سمت باکتری های آمونیاک ساز و سپس $NH_{4}^{+}$، و تبدیل $NH_{4}^{+}$ به $NO_{3}^{-}$ توسط باکتری های نیترات ساز و جذب $NH_{4}^{+}$ و $NO_{3}^{-}$ توسط ریشه]