بخشی از مجتمع پروتئینی است که به مجتمع منفذ هستهای شناخته شده و از درون پوشش هستهای (که یک جفت غشای دوتایی است که هسته سلول های یوکاریوتی را در بر می گیرد) عبور می کند. در پوشش هستهای سلولهای مهره دار وجود دارد، که البته تعدادشان بسته به نوع سلول و این که در چه مرحله ای از چرخه زندگی قرار دارد، منفذ هسته در سلولهای یکسلولی و چندسلولی محل انتقال مواد (ماهیچهها، آرانایان(CARN)، سیگنالهای سلولی و عوامل رشد) بین هسته و سیتوپلاسم است. این فرآیند با کنترل دقیق شده توسط منفذ هسته انجام می شود.