در قسمت های سخت بدن جانداران در داخل رسوبات مدفون شده، هنگام نفوذ آب های زیرزمینی به داخل این رسوبات، هم زمان با حل شدن بخش هایی از جسد جاندار، مولکول های مواد معدنی موجود در آب زیرزمینی، جایگزین آن می شوند. به این ترتیب بدون اینکه تغییری در شکل ظاهری قسمت های سخت جاندار داده شود، ترکیب شیمیایی مواد تشکیل دهنده آن عوض می شود. مواد معدنی جانشین شده معمولاً ترکیب سیلیسی و آهکی است (شکل ۶ - الف و ب).