نقش «لایه نفوذناپذیر» در شکلگیری مخروط افت چاه بسیار مهم است. زمانی که لایه نفوذناپذیر در زیر زمین وجود دارد، مانع از نفوذ آب به لایههای زیرینتر میشود. این باعث میشود آب در لایههای بالاتر انباشته شود. در زمان حفاری یک چاه، با رسیدن حفاری به این لایه نفوذناپذیر، آب ذخیرهشده به سمت چاه جهت پیدا میکند و حجم زیادی از آب تخلیه میشود که به شکلگیری مخروط افت چاه منجر میشود.
وجود لایه نفوذناپذیر باعث تمرکز و حرکت آب به سمت چاه میشود و نقش کلیدی در کنترل و مدیریت منابع آبی و جلوگیری از هدر رفتن آنها ایفا میکند.